Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AMER3Q8N944 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AMER3Q8N944 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms