Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NLRP13Q86W25 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms