Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
USP34Q70CQ2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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