Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BEND4Q6ZU67 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BEND4Q6ZU67 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms