Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
WDR88Q6ZMY6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms