Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUSD1Q6UWL2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms