Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD3Q6STE5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms