Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSK4Q6SA08 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms