Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3F3CQ6NXT2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms