Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ANKRD40Q6AI12 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms