Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ATG9BQ674R7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG9BQ674R7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG9BQ674R7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATG9BQ674R7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms