Protein–RNA interactions for Protein: Q66K66

TMEM198, Transmembrane protein 198, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM198Q66K66 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM198Q66K66 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM198Q66K66 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms