Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms