Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SDK2Q58EX2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SDK2Q58EX2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms