Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC153Q494R4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms