Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
KRTAP13-3Q3SY46 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms