Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGSM1Q2NKQ1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGSM1Q2NKQ1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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