Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC96Q2M329 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC96Q2M329 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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