Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ISXQ2M1V0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms