Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RTN1Q16799 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RTN1Q16799 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms