Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NDUFA9Q16795 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms