Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ECM1Q16610 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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