Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC1Q15915 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms