Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SKIV2LQ15477 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms