Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SEC23BQ15437 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC23BQ15437 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SEC23BQ15437 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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SEC23BQ15437 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC23BQ15437 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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