Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SYCP1Q15431 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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SYCP1Q15431 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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SYCP1Q15431 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SYCP1Q15431 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SYCP1Q15431 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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SYCP1Q15431 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SYCP1Q15431 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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