Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RYR3Q15413 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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