Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RABEP1Q15276 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RABEP1Q15276 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RABEP1Q15276 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RABEP1Q15276 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RABEP1Q15276 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RABEP1Q15276 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RABEP1Q15276 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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