Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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RAB3GAP1Q15042 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3GAP1Q15042 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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