Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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R3HDM1Q15032 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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R3HDM1Q15032 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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