Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TNIP1Q15025 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNIP1Q15025 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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