Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GAPVD1Q14C86 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GAPVD1Q14C86 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms