Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SHPRHQ149N8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHPRHQ149N8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
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