Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHD4Q14839 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
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