Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SEMA3AQ14563 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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