Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TUBA3CQ13748 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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