Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HDAC1Q13547 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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