Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TCIRG1Q13488 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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