Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDE3BQ13370 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDE3BQ13370 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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