Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLAMF1Q13291 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SLAMF1Q13291 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLAMF1Q13291 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms