Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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CALCOCO2Q13137 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CALCOCO2Q13137 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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