Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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PRDM2Q13029 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
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PRDM2Q13029 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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PRDM2Q13029 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
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PRDM2Q13029 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
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PRDM2Q13029 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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PRDM2Q13029 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM2Q13029 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
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