Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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CNTN1Q12860 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CNTN1Q12860 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTN1Q12860 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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