Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMARCB1Q12824 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMARCB1Q12824 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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