Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC173Q0VFZ6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms