Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGNL1Q0VF96 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms