Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCDC15Q0P6D6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms