Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
C2orf54Q08AI8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
C2orf54Q08AI8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms