Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TGM3Q08188 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms