Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAD51Q06609 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAD51Q06609 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms